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一、工程合同超期怎么办
工程合同超期涉及多方面法律问题，处理方式如下：
首先，需查看合同中对工期及超期违约责任的具体约定。若有明确规定，依约追究违约方责任。比如约定了违约金数额或计算方式，违约方应按此支付。
其次，分析超期原因。若因不可抗力，如自然灾害、政府行为等导致，一般可部分或全部免除责任，但需及时通知对方并提供证明。若是一方自身过错，像施工方组织不力、管理不善等，则要承担违约责任。
再者，超期影响到工程进度和交付，受损方有权要求违约方采取补救措施，如加快施工进度，尽量减少超期带来的损失。
最后，若双方就超期责任及赔偿无法协商一致，受损方可考虑通过法律途径解决，向有管辖权的法院或仲裁机构提起诉讼或申请仲裁，维护自身合法权益。在整个过程中，注意收集和保存与超期相关的证据，如往来函件、会议纪要、施工记录等，以便在纠纷处理中处于有利地位。
二、工程合同超过3年起诉有效吗
工程合同超过3年起诉是否有效，需依据具体情况判断。诉讼时效一般为3年，自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
若超过3年起诉，对方以诉讼时效抗辩，且法院认定该抗辩成立，那么原告可能丧失胜诉权。但存在特殊情形，例如诉讼时效中断、中止的情况。诉讼时效中断是指在诉讼时效进行中，因法定事由的发生致使已经进行的诉讼时效期间全部归于无效，从中断时起，诉讼时效期间重新计算。如债权人向债务人主张过权利，像发出书面催款函等，可导致诉讼时效中断。诉讼时效中止是指在诉讼时效期间的最后6个月内，因法定事由而使权利人不能行使请求权的，诉讼时效期间的计算暂时停止，待阻碍时效进行的法定事由消除后，诉讼时效期间继续计算。
所以，工程合同超过3年起诉，不能一概而论其是否有效，要综合案件实际情况，看是否存在导致诉讼时效中断、中止的情形来具体分析。
三、工程款超过三年法院还受理吗
工程款超过三年法院仍会受理。诉讼时效的规定并不影响法院对案件的受理，法院在收到起诉材料符合立案条件时即会受理案件。
虽然诉讼时效一般为三年，但存在多种可能导致诉讼时效中断、中止的情形。例如，在这三年间，债权人向债务人主张过权利，像发送书面催款函、通过短信微信催款等，会引起诉讼时效中断，从中断时起，诉讼时效期间重新计算。
即便不存在诉讼时效中断、中止的情况，超过三年诉讼时效后，债务人若未提出诉讼时效抗辩，法院也不会主动适用诉讼时效的规定进行裁判。债务人一旦提出诉讼时效抗辩，债权人虽可能丧失胜诉权，但实体权利并不消灭，若债务人自愿履行工程款债务，债权人仍有权接受。所以，工程款超过三年，依然可向法院起诉，由法院审查具体情况作出相应裁判。
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